Influenza

Influenza

Fecha: 29/05/2020 – 01/07/2020 Autor(es): Alfredo Bruno Maritza Olmedo, Denisses Portugal, María Angélica Becerra, Marcela Mejía, María Cristina Pacurucu, Elizabeth Campoverde, Manuel González, Alberto Orlando, Natalia Goñi y Doménica de Mora/Pág. 2
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Vigilancia genómica: Subtipo de Influenza predominante, durante la epidemia estacional en Ecuador, 2018

Vigilancia genómica: Subtipo de Influenza predominante, durante la epidemia estacional en Ecuador, 2018

Introducción

Los virus de Influenza cada año ocasionan aproximadamente de 3 a 5 millones de casos severos de la enfermedad causando una mortalidad entre 291.243 a 465.832 individuos anualmente (4.0 a 8.8 por 100.000 habitantes). (1, 2) El Ecuador es un país tropical, en la cual existen dos periodos de circulación para el virus de influenza uno en el mes de diciembre-enero y un pico secundario durante los meses de julio y agosto, estas consideraciones epidemiológicas sumado a la ubicación geográfica del país en la línea ecuatorial, hace que reciba influencias climatológicas del hemisferio norte y del hemisferio sur, razón por la cual es necesario evaluar de manera constante que formulación de la vacuna es más apropiada para el país, (hemisferio norte o hemisferio sur).Objetivos. Identificar el subtipo de Influenza predominante durante la epidemia estacional, Realizar la caracterización genética del subtipo de influenza predominante, Analizar la región de la Hemaglutinina y establecer su relación evolutiva, Comparar los sitios de glicosilación de las cepas ecuatorianas con la cepa de referencia vacunal. Metodología. Con el fin de determinar las líneas basales se siguió la metodología  de la OMS con base a la proporción de muestras positivas recibidas en el Centro Nacional de Influenza del INSPI y sus laboratorios zonales desde el año 2012 hasta el 2017. Para los procesos de laboratorio se utilizó la técnica de qRT-PCR (protocolo del CDC de Atlanta). Se seleccionaron muestras positivas representativas del país, para su posterior envío al CDC donde fueron secuenciadas. Se utilizó la plataforma GISAID para obtener las secuencias nacionales y de referencia, con la finalidad de estudiar las relaciones genéticas entre los virus de influenza identificados, las cuales, fueron comparadas con cepas globales. Resultados: El subtipo identificado en mayor proporción fue el H1pdm en un 87%, seguido del subtipo H3 (11%) e Influenza B (2%), entre las muestras analizadas. Luego de realizar los análisis filogenéticos del subtipo predominante H1 pdm, las muestras ecuatorianas se agruparon dentro del genotipo 6B.1. Al comparar las secuencias con la cepa vacuna se evidencian de 6 a 7 cambios de residuos aminoacídicos, sin embargo no existen diferencias en los sitios de glicosilación con respecto a la cepa A/Michigan45/2015.

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